1 Naples - Villareal
2 Rangers - Sporting Portugal
3 Sparta Prague - Liverpool
4 ANDERLECHT - AJAX
5 Poznan - Braga
6 Besiktas - Dinamo Kiev
7 Bale - Spartak Moscou
8 Young Boys - Zenit
9 Aris Salonique - Manchester city
10 PAOK - CSKA Moscou
11 Seville - Porto
12 Rubin Kazan - Twente
13 Lille - PSV
14 Benfica - Stuttgart
15 Bate - PSG
16 Metalist - Leverkusen

Les quatre équipes ayant eu le meilleur bilan en phase de groupes, à savoir le Spartak, Braga, l'Ajax et Twente, seront têtes de série pour le tirage au sort des 16es de finale , tout comme les 12 vainqueurs de groupe de l'Europa League. Les quatre autres (Rubin, Bâle, les Rangers et Benfica) seront placées dans un pot avec les 12 deuxièmes.

Ces équipes recevront lors du match aller le 17 février et se déplaceront sept jours plus tard. Aucune équipe ne peut rencontrer un club de son pays en 16es de finale tandis que le tirage au sort des 8es de finale est complètement ouvert.

La finale aura lieu à Dublin, République d'Irlande, mercredi 18 mai 2011.